Чорні сонячні панелі залишаються більш популярними та ефективними в порівнянні з прозорими, які, хоча й мають естетичний вигляд, поступаються в продуктивності. Прозорі сонячні панелі, або clear solar panels, можуть бути використані в архітектурі будівель, проте їхня ефективність коливається від 1% до 22%, тоді як стандартні чорні панелі забезпечують ефективність до 24%. Зокрема, повністю прозорі панелі мають найнижчу ефективність, а напівпрозорі досягають 7-12%.
Крім того, прозорі панелі є значно дорожчими: їхня вартість варіюється від 270 до 1615 доларів за квадратний метр, що в 2-4 рази дорожче за традиційні чорні панелі. Це робить їх менш придатними для домашнього використання, оскільки для досягнення помітної генерації електроенергії потрібно буде встановити значно більше прозорих панелей. Чорні панелі залишаються кращим вибором для більшості власників житла, тоді як прозорі панелі можуть бути доцільними для комерційних будівель із великими скляними фасадами.